Montagem e anotação dos genomas plastidiais do alo tetraploide _Stylosanthes capitata_ (FABACEAE) e seus parentais _S. pilosa_ e _S. macrocephala_
Montagem e anotação dos genomas plastidiais do alo tetraploide Stylosanthes capitata (FABACEAE) e seus parentais S. pilosa e S. macrocephala
<danyelleferreira21@hotmail.com>
O gênero Stylosanthes é demasiadamente
diversificado e polimórfico, pertencente à família Fabaceae, e compreende
espécies tropicais e subtropicais, a maioria delas descritas para a América do
Sul, sendo o Brasil o principal centro de origem e diversidade do gênero.
Apesar de sua importância econômica, o gênero Stylosanthes ainda
apresenta pouca caracterização gênica e sua taxonomia e sistemática complexa
problematiza a delimitação e identificação de espécies. Além do mais, a
ocorrência de híbridos poliploides (alopoliploides) no gênero dificulta a
caracterização das espécies. Estudos anteriores revelaram que S. capitata
é um alotetraploide, provavelmente originado do cruzamento entre S.
macrocephala e S. pilosa. Sabe-se que o genoma plastidial (cloroplasto) é circular e
possui uma estrutura quadripartida composta por uma região longa de cópia única
(LSC) e uma região curta de cópia única (SSC) sendo separadas por um par de
regiões repetidas e invertidas (IRs). O DNA dos cloroplastos é muito
utilizado em estudos filogenéticos e de reconhecimento parental em híbridos em
virtude de sua herança uniparental e na maioria das vezes possuir herança
materna, como também é o caso de Stylosanthes. O objetivo deste trabalho
foi obter e analisar comparativamente os genomas plastidiais dos parentais S.
macrocephala e S. pilosa e do alotetraploide S. capitata, com
a finalidade gerar suporte genômico para um melhor conhecimento da origem de S.
capitata e sua constituição gemônima.
The genus Stylosanthes is very diverse and polymorphic, belonging
to the family Fabaceae, and comprises tropical and subtropical species, most of
them described for South America, being Brazil the main center of origin and
diversity of the genus. Despite its economic importance, the genus Stylosanthes
has still little genetic characterization and its complex taxonomy and
systematics hampers the species delimitation and identification. Moreover, the
occurrence of polyploid hybrids (allopolyploids) in the genus makes it
difficult to characterize the species. Previous studies have shown that S.
capitata is an allotetraploid, probably originating from the cross between S.
macrocephala and S. pilosa. The plastid genome (chloroplast) is
known to be circular and has a quadripartite structure composed of a long
single copy region (LSC) and a short single copy region (SSC) being separated
by a pair of inverted repeated (IRs) regions. Chloroplast DNA is widely used in
phylogenetic and parental recognition studies in hybrids because of their
uniparental inheritance and most often has maternal inheritance, as is the case
with Stylosanthes. The objective of this work was to obtain and
comparatively analyze the plastid genomes of the parental S. macrocephala
and S. pilosa and the allotetraploid S. capitata, in order to
generate genomic support for a better understanding of the origin of S.
capitata and its genomic constitution.
Dr. Santos, Valdevan Rosendo dos.
Stylosanthes.
Alopoliploidia.
Bioinformática.