Análise bioinformática do perfil de expressão gênica em melanoma: enfoque na via do P450

O melanoma é o câncer de pele mais frequente do Brasil e corresponde a cerca de 30% dos cânceres malignos. Sua taxa de mortalidade chega até a 90% em razão da rápida capacidade de gerar metástases. O prognóstico é considerado ruim, com sobrevida média de 5 anos. O objetivo do estudo é identificar os genes da família do citocromo P450 (CYP450) alterados no câncer de pele melanoma e associá-los ao aumento da resistência a medicamentos quimioterápicos, para assim estabelecer qual tratamento poderá ter menos eficácia em indivíduos com determinado perfil genético. Foi realizado um estudo de prevalência através da análise de 565 amostras de câncer tipo melanoma. Os critérios de inclusão foram pacientes com diagnóstico histopatológico e que possuíam mais de 18 anos; e os de exclusão foram pacientes com qualquer outro tipo de câncer secundário ou hereditário. As amostras foram obtidas através do banco de dados público do Atlas do Genoma do Câncer (TCGA), não havendo identificação de nenhum indivíduo. O software R/Biocondutor foi utilizado para extrair dados genômicos das amostras. A análise das vias moleculares teve sua realização no banco de dados DAVID e análise de expressão proteica e sobrevida através da plataforma The Cancer Proteome Atlas (TCPA). Considerou-se intervalo de confiança de 95% e significância de 5%. Os resultados evidenciaram aumentos e diminuições nas expressões de genes da via CYP450 que impactaram diretamente na quimiorresistência e sobrevida dos pacientes.

Melanoma is the most frequent skin cancer in Brazil and corresponds to about 30% of malignant cancers. Its mortality rate reaches up to 90% due to its rapid ability to generate metastases. The prognosis is considered poor, with a median survival of 5 years. The aim of the study is to identify the genes of the cytochrome P450 (CYP450) family that are altered in melanoma skin cancer and associate them with increased resistance to chemotherapy drugs, in order to establish which treatment may be less effective in individuals with a certain genetic profile. A prevalence study was carried out through the analysis of 565 melanoma’s cancer samples. Inclusion criteria were patients with a histopathological diagnosis who were over 18 years of age; and those excluded were patients with any other type of secondary or hereditary cancer. The samples were obtained through the public database of the Cancer Genome Atlas (TCGA), without identification of any individual. The R/Bioconductor software was used to extract genomic data from the samples. The analysis of molecular pathways was performed in the DAVID database and analysis of protein expression and survival through The Cancer Proteome Atlas (TCPA) platform. A confidence interval of 95% and a significance of 5% was considered. The results showed increases and decreases in the expression of genes of the CYP450 pathway that directly impacted the chemoresistance and survival of patients.