Comparação ampla das famílias de proteínas A-Atpases em genomas de espécies representantes da Táxon Prokarya

A ATPase do tipo A é complexo enzimático que funcionam através da força motriz de prótons, sintetizando adenosina trifosfato (ATP) e é conhecida por ser predominantemente encontrada em espécies de Archaea, sendo considerada semelhante à do tipo V, encontradas em eucariotos. Por sua vez, organismos procariotos apesar de apresentarem forma simples, conseguem realizar com sucesso os mecanismos necessários para sua manutenção e evolução, sendo os principais organismos estudados atualmente, devido a sua grande diversidade, alta possibilidade de cultura em laboratório, além de possuírem genomas relativamente menores e melhores para ser estudados. Atualmente existem vários genomas preditos completos para um grande número de procariotos, permitindo assim descobertas a respeito de muitos aspectos da biologia desses micro-organismos. Assim, o objetivo principal deste trabalho foi prospectar a família de proteínas ATPases em genomas de representantes do sSuperdomínio Prokarya, ou seja, tanto do domínio Eubacteria quanto Archaea. Para esta finalidade, foi realizado o levantamento da distribuição das famílias de ATP sintases em 100 proteomas de interesse, inicialmente, para a identificação e anotação de proteínas, em seguida, foi realizada a inferência filogenética e a análise dos consensos logos. Os resultados mostram que as funções “ABC e AAA-ATPase" divergiram precocemente nos domínios Archaea e Eubacteria e várias outras funções são encontradas em ambos, isso implica na compreensão que A-ATPase não é somente predominante em Archaea. Apesar de desempenhar muitas funções, não há muitos domínios conservados, mas apenas um que está relacionado à multifuncionalidade. Também, é possível que novas famílias foramtenham sido encontradas.

The A-ATPase family is known to be predominantly found in Archaea species and is considered to be similar to type V, found in eukaryotes. In turn, prokaryotic organisms, despite having a simple form, can successfully perform the mechanisms necessary for their maintenance and evolution, being the main organisms studied today, due to their great diversity, high possibility of culture in the laboratory, in addition to having relatively smaller genomes. and better to study. Currently, there are several complete predicted genomes for a large number of prokaryotes, thus allowing discoveries about many aspects of the biology of these microorganisms. Thus, the main objective of this work was to prospect the ATPase protein family in genomes of representatives of the Prokarya superdomain, that is, of both the Eubacteria and Archaea domains. For this purpose, we carried out a survey of the distribution of ATP synthase families in 100 proteomes of interest, initially, for the identification and annotation of proteins, then phylogenetic inference and the analysis of the logos consensus were performed. The results show that the "ABC and AAA-ATPase" functions diverged early in the Archaea and Eubacteria domains and several other functions are found in both, which implies the understanding that A-ATPase is not only predominant in Archaea. there are not many conserved domains, but only one that is related to multifunctionality. Also, it is possible that new families were found.