Estudo de associação entre o polimorfismo rs405509 no gene _APOE_ e a hanseníase na população do Agreste alagoano

A hanseníase é uma doença infecciosa causada pelo Mycobacterium leprae, que afeta principalmente a pele e os nervos periféricos. Uma combinação de fatores ambientais e da genética do hospedeiro, são necessárias para levar ao desenvolvimento da doença pela exposição ao bacilo. Dessa forma, a presença de SNPs, principalmente em genes relacionados à fisiopatologia da hanseníase, podem estar associados ao risco da doença. O gene APOE, é responsável por codificar a apolipoproteína E (ApoE) que medeia a transferência de lipídios entre as lipoproteínas circulantes e os tecidos, e pode estar associado à hanseníase devido seu papel nas vias metabólicas lipídicas durante a infecção pelo M. leprae. O presente estudo investigou a associação do polimorfismo rs405509-APOE na hanseníase e suas formas clínicas na população do agreste alagoano. Foi realizado um estudo caso-controle, em que foram incluídos pacientes com hanseníase recrutados no Centro de Referência Integrada de Arapiraca (CRIA) para compor o grupo de casos e indivíduos saudáveis recrutados no hemocentro de Arapiraca (HEMOAR) para compor o grupo de controle. Após a coleta das amostras (sangue total) foi realizada a extração do DNA através do método de salting-out. A genotipagem em ambos os grupos foi realizada através do método de discriminação alélica por PCR em tempo real utilizando sondas do tipo TaqMan. Em seguida foram obtidas as estimativas de associação genética entre o SNP rs405509 e a hanseníase através do modelo de regressão logística utilizando a Odds Ratio (OR) como medida de associação com a hanseníase, através da plataforma SNPStats. Foram recrutados 188 pacientes e 264 controles, sendo o sexo masculino predominante em ambos os grupos. Os pacientes apresentaram média de idade de 52 anos, enquanto os controles tiveram média de idade de 33 anos. A classificação operacional foi de 68,2% de pacientes multibacilares e 15,6% pacientes paucibacilares. Os resultados mostraram que as frequências genotípicas obedeceram ao equilíbrio de Hardy-Weinberg no grupo controle. O SNP rs405509 no gene APOE apresentou frequência para o alelo T de 40% nos casos e 39% no grupo controle. No desenho caso-controle e de associação genética com a hanseníase, os resultados demonstraram a não associação do SNP estudado com a hanseníase na população investigada, mesmo após ajuste para a covariável sexo. Além disso, a análise de associação com a classificação operacional (MB vs PB) também não resultou em associação mesmo após ajuste (p>0,05). Os achados do presente estudo contribuem na identificação de marcadores genéticos associados com a hanseníase na região do agreste alagoano 

Leprosy is an infectious disease caused by Mycobacterium leprae, which mainly affects the skin and peripheral nerves. A combination of environmental factors and host genetics are required to lead to the development of disease from exposure to the bacillus. Thus, the presence of SNPs, mainly in genes related to the pathophysiology of leprosy, may be associated with the risk of the disease. The APOE gene is responsible for encoding apolipoprotein E (ApoE), which mediates the transfer of lipids between circulating lipoproteins and tissues, and may be associated with leprosy due to its role in lipid metabolic pathways during M. leprae infection. The present study investigated the association of the rs405509-APOE polymorphism in leprosy and its clinical forms in the population of the rural region of Alagoas. A case-control study was carried out, in which leprosy patients recruited at the Integrated Reference Center of Arapiraca (CRIA) were included to compose the case group and healthy individuals recruited at the Arapiraca Blood Center (HEMOAR) to compose the control group. After collecting the samples (whole blood), DNA extraction was performed using the saltingout method. Genotyping in both groups was performed using the allelic discrimination method by real-time PCR using TaqMan-type probes. Then, estimates of the genetic association between the SNP rs405509 and leprosy were obtained through the logistic regression model using the Odds Ratio (OR) as a measure of association with leprosy, through the SNPStats platform. A total of 188 patients and 264 controls were recruited, with males predominating in both groups. The patients had a mean age of 52 years, while the controls had a mean age of 33 years. The operational classification was 68.2% MB patients and 15.6% PB patients. The results showed that the genotype frequencies obeyed the Hardy-Weinberg equilibrium in the control group. The SNP rs405509 in the APOE gene showed a frequency for the T allele of 40% in the cases and 39% in the control group. In the case-control and genetic association with leprosy design, the results demonstrated the non-association of the studied SNP with leprosy in the investigated population, even after adjusting for the covariable sex. Furthermore, the association analysis with the operational classification (MB vs PB) also did not result in an association even after adjustment (p>0.05). Thus, the findings of the present study contribute to the identification of genetic markers associated with leprosy in the rural region of Alagoas.