Análise de diversidade genética em peixes circumtropicais da ordem carangiformes

Espécies circumtropicais representam 1% dos peixes encontrados ao longo dos oceanos, constituídos por ordens de grande importância ecológica e econômica, como é a ordem Carangiformes. Essa ordem é representada por cerca de 1100 espécies, distribuídas por 34 famílias. Três destas famílias comercialmente importantes apresentam destaque dentro desta ordem, são elas: Carangidae, Rachycentridae e Coryphaenidae. Destas três famílias, quatro espécies circumtropicais foram avaliadas sob o ponto de vista genético: Alectis ciliaris, Elagatis bipinnulata, Rachycentron canadum e Coryphaena equiselis, sendo alvo de constantes estudos, principalmente envolvendo análises genéticas. Para as análises genéticas, o marcador molecular Citocromo Oxidase I (COI), conhecido popularmente como DNA Barcode, foi utilizado para acessar a diversidade genética nesses quatro táxons. As sequências georreferenciadas foram obtidas no banco de dados de domínio público BOLD Systems. Posteriormente, elas foram alinhadas e editadas, e em seguida foram calculadas as distâncias intraespecíficas utilizando o método K2P. Aliado as métricas de distâncias genéticas, dois métodos de delimitação de linhagens foram utilizados (GYMC e ASAP), para avaliar a coesão evolutiva intraespecífica. Além disso, utilizamos o BAPS para avaliar detectar estruturas populacionais. Nossos dados revelaram estruturações populacionais envolvendo três espécies: A. ciliaris, E. bipinnulata e R. canadum. As maiores variações intraespecíficas envolvendo esses três táxons foi de 1.2%. Por outro lado, foram detectadas duas linhagens com divergências profundas envolvendo C. equiselis (4.1%), ou seja, maior que o limiar de (2%) de variação genética, o que sugere se tratar de possíveis linhagens crípticas. A maior parte das estruturações populacionais detectadas foram encontradas em simpatria, na região do Indo-Pacífico Central, um hotspot de biodiversidade. Já as duas linhagens de C. equiselis detectadas, podem estar relacionadas aos efeitos de isolamento por distância geográfica, aliados aos efeitos de temperatura e correntes marítimas dispares, em que as duas linhagens se encontram. Nesse contexto, nossos resultados destacam a aplicação e efetividade do COI em detectar descontinuidades genéticas e linhagens enigmáticas. Esperamos que essas informações possam servir de alicerce para manejo e conservação dessas espécies ao longo da sua distribuição. 

Circumtropical species represent 1% of the fish found throughout the oceans, made up of orders of great ecological and economic importance, such as the order Carangiformes. This order is represented by about 1100 species, distributed among 34 families. Three of these commercially important families stand out within this order, namely: Carangidae, Rachycentridae and Coryphaenidae. Of these three families, four circumtropical species have been evaluated under the genetic point of view: Alectis ciliaris, Elagatis bipinnulata, Rachycentron canadum, and Coryphaena equiselis, being the target of constant studies, mainly involving genetic analysis. For the genetic analyses, the molecular marker Cytochrome Oxidase I (COI), popularly known as DNA Barcode, was used to access the genetic diversity in these four taxa. Georeferenced sequences were obtained from the public domain database BOLD Systems. Subsequently, they were aligned and edited, and then intraspecific distances were calculated using the K2P method. Allied to the genetic distance metrics, two lineage delimitation methods were used (GYMC and ASAP), to assess intraspecific evolutionary cohesion. In addition, we used BAPS to assess detecting population structures. Our data revealed population structures involving three species: A. ciliaris, E. bipinnulata, and R. canadum. The largest intraspecific variation involving these three taxa was 1.2%. On the other hand, two lineages with deep divergences involving C. equiselis were detected (4.1%), i.e., higher than the (2%) threshold of genetic variation, suggesting that they are possible cryptic lineages. Most of the detected population structures were found in sympatry, in the Central Indo-Pacific region, a biodiversity hotspot. The two detected lineages of C. equiselis, on the other hand, may be related to isolation effects by geographical distance, combined with the effects of temperature and disparate sea currents, in which the two lineages are found. In this context, our results highlight the application and effectiveness of COI in detecting genetic discontinuities and cryptic lineages. We hope that this information can serve as a foundation for management and conservation of these species throughout their distribution.