Avaliando os fatores que afetam o tamanho do genoma em Condrictes
Avaliando os fatores que afetam o tamanho do genoma em Condrictes
<jeferson.silva@arapiraca.ufal.br>
Os genomas eucarióticos diferem amplamente em tamanho, porém os fatores evolutivos que moldaram essa variação são pouco conhecidos em condrictes. As informações sobre o tamanho do genoma (GS) estão disponíveis para muitos táxons dentro desse grupo. Entretanto, trabalhos envolvendo a variação do GS são meramente descritivos, não elucidando quais processos evolutivos moldam a sua diversidade. Neste trabalho, por meio de métodos filogenéticos comparativos, buscamos entender quais processos moldam a variação do GS. Para isso, utilizamos variáveis bióticas (estratégia reprodutiva) e abióticas (amplitude de temperatura e salinidade). Ao todo, 114 GS de tubarões, arraias e quimeras foram avaliados. Nossos dados revelaram que o GS varia em cerca de 16,45 vezes entre as espécies. A reconstrução filogenética mostrou cinco clados bem suportados dentro dos condrictes. O K de Bloomberg revelou que não houve sinal filogenético entre a variação do GS e sua trajetória filogenética (K = 0,5; p-value: 0,72). Já as análises por meio de métodos filogenéticos comparativos revelaram que as amplitudes térmica e osmótica estão associadas a variação do GS (p< 0.03, r 2=0.061). Além disso, a estratégia reprodutiva das espécies também mostrou forte associação com a variação do GS (p< 0.007, r 2=0.063). Assim, as espécies com os maiores genomas são ovovíparas e as com os menores são vivíparas, seguidos pelas ovíparas. A amplitude de temperatura associada à salinidade, bem como as estratégias reprodutivas associadas ao GS possivelmente estão atrelados à expansão e contração do número de sequências repetitivas distribuídas pelo genoma. A relação significativa aqui encontrada entre GS e estratégia reprodutiva em condrictes pode indicar uma possível adaptação evolutiva desses organismos em relação à sua reprodução. Nesse sentido, nossas descobertas revelam as múltiplas facetas evolutivas que esse grupo antigo e diverso experimentou durante a sua trajetória filogenética.
Eukaryotic genomes differ widely in size, but the evolutionary factors that shaped this variation are poorly known in chondrichthyes. Genome size (GS) information is available for many taxa within this group. However, works involving GS variation are merely descriptive, not elucidating which evolutionary processes shape its diversity. In this work, through comparative phylogenetic methods, we seek to understand which processes shape GS variation. We used biotic (reproductive strategy) and abiotic (temperature and salinity amplitude) variables for this. In all, 114 GS of sharks, rays and chimaeras were evaluated. Our data revealed that GS varies by about 16.45 times between species. Phylogenetic reconstruction showed five well-supported clades within the chondrichtes. Bloomberg's K revealed that there was no phylogenetic signal between the GS variation and its phylogenetic trajectory (K = 0.5; p-value: 0.72). Analyzes using comparative phylogenetic methods revealed that thermal and osmotic amplitudes are associated with GS variation (p< 0.03, r 2=0.061). Furthermore, the species’ reproductive strategy also showed a strong association with the variation in GS (p< 0.007, r 2=0.063). Thus, species with the largest genomes are ovoviviparous and those with the smallest are viviparous, followed by oviparous. The temperature range associated with salinity and the reproductive strategy associated with GS are possibly linked to the expansion and contraction of the number of repetitive sequences distributed throughout the genome. The significant relationship found here between GS and reproductive strategy in chondrichthyes may indicate a possible evolutionary adaptation of these organisms in relation to their reproduction. In this sense, our findings reveal the multiple evolutionary facets that this ancient and diverse group experienced during its phylogenetic trajectory.
Dr. Broetto, Leonardo.
Elasmobrânquios .
Holocephali.
Métodos filogenéticos comparativo.