Acessando as variações do tamanho do genoma em peixes marinhos da ordem Tetraodontiformes

Acessando as variações do tamanho do genoma em peixes marinhos da ordem Tetraodontiformes

Autor(a)
Silva, Pedro Gabriel Marques da.
<pedro.marques@arapiraca.ufal.br>
Ano de publicação
2024
Data da defesa
19/02/2024
Curso/Outros
Ciências Biológicas
Número de folhas
44
Tipo
TCC - Trabalho de Conclusão de Curso
Local
UFAL, Campus Arapiraca, Unidade Educacional ARAPIRACA
Resumo

O tamanho do genoma (GS) é um fator biológico que apresenta uma grande variação entre os táxons, estando intrinsecamente associada à evolução das espécies. Entretanto os mecanismos que moldam a sua variação ainda permanecem pouco compreendidos em alguns grupos. Nos Tetraodontiformes essa característica é peculiar, pois são conhecidos por possuírem os menores conteúdos de DNA celular, sendo considerados ótimos modelos evolutivos em estudos comparativos entre os vertebrados. Nos últimos anos um grande número de estudos focando a variação do GS têm sido explorados, embora sejam poucos os trabalhos que se concentram em avaliar essa variação em um contexto filogenético e ecológico. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi analisar se fatores ecológicos e cladogenéticos estão relacionados à variação do GS nos Tetraodontiformes. Para isso, acessamos os dados do GS do banco de dados genome size e reconstruímos uma filogenia composta por 44 espécies, utilizando os genes mitocondriais COI, 12S, 16S e o nuclear RAG1. Avaliamos o sinal filogenético do GS, assim como, utilizamos métodos filogenéticos comparativos (PGLs) para avaliar se fatores ambientais e ecológicos moldam a sua variação. As informações ambientais e ecológicas foram extraídas do Fishbase e do Bio-oracle. As análises filogenéticas revelaram a existência de dois clados bem suportados que permitiram avaliar o GS. O K de Bloomberg revelou a presença de sinal filogenético (K = 0.86), indicando que a variação do GS segue uma trajetória filogenética. Não encontramos relações entre o GS por meio das análises de PGLs. Contudo, ao comparar o GS com os atributos ecológicos e ambientais através da correlação de Pearson, encontramos uma associação com o comprimento corporal (p=0.02). Dessa forma, o nosso estudo sugere que as variações no GS dos Tetraodontiformes são moldadas por processos cladogenéticos e fenotípicos, o que demonstra a íntima relação dessa variante genética em processo micro e macroevolutivos na diversificação evolutiva do grupo.

Abstract

The genome size (GS) is a biological factor that shows significant variation among taxa, being intrinsically associated with the evolution of species. However, the mechanisms shaping its variation still remain poorly understood in some groups. In Tetraodontiformes, this characteristic is peculiar as they are known to have the smallest cellular DNA contents, making them excellent evolutionary models in comparative studies among vertebrates. In recent years, a large number of studies focusing on GS variation have been explored, though few concentrate on assessing this variation in a phylogenetic and ecological context. In this regard, the main objective of this work was to analyze whether ecological and cladogenetic factors are related to GS variation in Tetraodontiformes. To achieve this, we accessed GS data from the genome size database and reconstructed a phylogeny comprising 44 species, using mitochondrial genes COI, 12S, 16S, and the nuclear RAG1. We assessed the phylogenetic signal of GS and used comparative phylogenetic methods (PGLs) to evaluate if environmental and ecological factors shape its variation. Environmental and ecological information was extracted from Fishbase and Bio-oracle. Phylogenetic analyses revealed the existence of two well-supported clades that allowed for GS evaluation. Blomberg's K revealed the presence of a phylogenetic signal (K = 0.86), indicating that GS variation follows a phylogenetic trajectory. We did not find relationships between GS through PGL analyses. However, when comparing GS with ecological and environmental attributes through Pearson correlation, we found an association with body length (p=0.02). Thus, our study suggests that variations in Tetraodontiformes' GS are shaped by cladogenetic and phenotypic processes, demonstrating the intimate relationship of this genetic variant in micro and macroevolutionary processes in the evolutionary diversification of the group. 

Orientador(a)
Dr. Jacobina, Uedson Pereira .
Banca Examinadora
Dr. Cruz, André Luis da.
Dr. Silva, Henrique Costa Hermenegildo da.
Palavras-chave
Peixes marinhos.
Variáveis marinhas.
Peixe - Filogenia.
Métodos filogenéticos comparativos.
Áreas do Conhecimento/Localização
Coleção Propriedade Intelectual (CPI) - BSCA.
Categorias CNPQ
2.00.00.00-6 Ciências biológicas.
Visualizações
113
Observações

Acesso restrito solicitado pelo autor. Provável liberação em 20 mar. 2025.