Estudo do polimorfismo RS3761863 no gene _LRRK2_ e a associação com a hanseníase na população do Agreste de Alagoas
Estudo do polimorfismo RS3761863 no gene LRRK2 e a associação com a hanseníase na população do Agreste de Alagoas
<pereirakamilasantoss@gmail.com>
A hanseníase é uma doença infecciosa causada pelo Mycobacterium leprae, que afeta principalmente a pele e os nervos periféricos. Uma combinação de fatores ambientais e genéticos são necessários para levar ao desenvolvimento da doença pela exposição ao bacilo. Dessa forma, a presença de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), principalmente em genes relacionados à fisiopatologia da hanseníase, podem estar associados a risco ou proteção da doença. O gene LRRK2 fornece instruções para a produção de uma proteína chamada dardarin, que é altamente expressivo nas células do sistema imune, estando relacionada a vias da inflamação, função mitocondrial e autofagia. O presente estudo investigou a associação do polimorfismo rs3761863-LRRK2 na hanseníase e suas classificações operacionais na população do agreste alagoano. Foi realizado um estudo caso-controle, em que foram incluídos pacientes com hanseníase recrutados no Centro de Referência Integrada de Arapiraca (CRIA) para compor o grupo de casos e indivíduos sem hanseníase recrutados no Hemocentro de Alagoas (HEMOAL) para compor o grupo de controle. Após a coleta das amostras biológicas (sangue total periférico) foi realizada a extração do DNA através do método de salting out. Posteriormente, a genotipagem em ambos os grupos foi realizada através do método de discriminação alélica por PCR em tempo real utilizando sondas do tipo TaqMan. Em seguida foram obtidas as estimativas de associação genética entre o SNP rs3761863 e a hanseníase através do modelo genético de regressão logística utilizando a OR como medida de associação com a hanseníase, através da plataforma SNPStats. Foram recrutados 178 pacientes e 264 controles, sendo o sexo masculino predominante em ambos os grupos apresentando 63% e 64%, respectivamente. A classificação operacional foi de 66% de pacientes multibacilares O SNP rs3761863 no gene LRRK2 apresentou frequência para o alelo T (polimórfico) de 41% nos casos e 42% no grupo controle. No desenho caso-controle e de associação genética com a hanseníase, os resultados demonstraram a não associação do SNP estudado com a hanseníase na população investigada, mesmo após ajuste para a covariável sexo (OR: 1,31; p-valor: 0,91, modelo codominante). Além disso, a análise de associação com a classificação operacional (MB vs PB) também não resultou em associação mesmo após ajuste (p>0,05), sendo assim o SNP no gene LRRK2 não está associado com a hanseníase MB (OR: 1,31; p-valor: 0,53 - modelo codominante). Outros modelos genéticos de regressão logística foram utilizados: dominante, recessivo, sobredominante e log aditivo e também não demonstraram associação com a doença. Em vista dos aspectos apresentados,os achados do presente estudo identificaram não associação do rs3761863-LRRK2 com a hanseníase na população do agreste de Alagoas, o que contribui na construção do painel de marcadores genéticos associados com a hanseníase no estado.
Leprosy is an infectious disease caused by Mycobacterium leprae, which mainly affects the skin and peripheral nerves. A combination of environmental and genetic factors are necessary to lead to the development of the disease through exposure to the bacillus. Therefore, the presence of single nucleotide polymorphisms (SNPs), mainly in genes related to the pathophysiology of leprosy, may be associated with risk or protection from the disease. The LRRK2 gene provides instructions for the production of a protein called dardarin, which is highly expressed in cells of the immune system and is related to inflammation pathways, mitochondrial function and autophagy. The present study investigated the association of the rs3761863-LRRK2 polymorphism in leprosy and its operational classifications in the rural population of Alagoas. A case-control study was carried out, including patients with leprosy recruited at the Arapiraca Integrated Reference Center (CRIA) to compose the group of cases and individuals without leprosy recruited at the Hemocentro de Alagoas (HEMOAL) to compose the control group. . After collecting the biological samples (peripheral whole blood), DNA extraction was carried out using the salting out method. Subsequently, genotyping in both groups was carried out using the real-time PCR allelic discrimination method using TaqMan probes. Genetic association estimates between the SNP rs3761863 and leprosy were then obtained through the genetic logistic regression model using OR as a measure of association with leprosy, through the SNPStats platform. 178 patients and 264 controls were recruited, with males predominating in both groups at 63% and 64%, respectively. The operational classification was 66% of multibacillary patients. The SNP rs3761863 in the LRRK2 gene presented a frequency for the T (polymorphic) allele of 41% in cases and 42% in the control group. In the case-control design and genetic association with leprosy, the results demonstrated the non-association of the SNP studied with leprosy in the investigated population, even afteradjustment for the covariate sex (OR: 1.31; p-value: 0.91 , codominant model). Furthermore, the analysis of association with the operational classification (MB vs PB) also did not result in an association even after adjustment (p>0.05), therefore the SNP in the LRRK2 gene is not associated with MB leprosy (OR: 1 .31; p-value: 0.53 - codominant model). Other genetic logistic regression models were used: dominant, recessive, overdominant and log additive and also showed no association with the disease. In view of the aspects presented, the findings of the present study identified no association of rs3761863-LRRK2 with leprosy in the rural population of Alagoas, which contributes to the construction of the panel of genetic markers associated with leprosy in the state.
Dr.ª Figueiredo, Elaine Virgínia Martins de Souza.
Ma. Freitas, Heloisa de Almeida.
Lepra .
Polimorfismo (Genética).
Polimorfismo de Nucleotídeo Único (SNP).